Het Europees Parlement mag niet meebeslissen over de inhoud van de overeenkomst tussen de EU en de VS. Het is echter mogelijk dat de Raad van de Europese Unie bij een bepaalde kwestie zogenoemde medebeslissingsbevoegdheid toekent aan het Europees Parlement. Op die manier is er meer controle op het proces en worden de Europese burgers beter vertegenwoordigd. In dat geval stemt de Raad bovendien niet meer bij unanimiteit, maar bij meerderheid.
Europarlementariër Sophie in 't Veld probeerde in de onlangs afgeronde onderhandelingen tevergeefs medebeslissingsbevoegdheid te krijgen voor het Europees Parlement. Begin september presenteerde ze voor het Europees Parlement een rapport waarin ze wederom aanbeveelt om die bevoegdheid te geven bij toekomstige onderhandelingen. De huidige overeenkomst zal 31 juli 2007 aflopen. De sterkere positie van het Parlement zal ervoor zorgen dat burgerrechten beter worden beschermd. Volgens In 't Veld en ook andere Europarlementariërs schuilt het gevaar vooral in de controle op het gebruik van de gegevens door de Amerikanen. Europeanen zijn op dit moment niet beschermd tegen misbruik van de gegevens door de Amerikaanse autoriteiten.
Vergroting van de invloed van het Europees Parlement is een issue dat al langer aan de orde is binnen de Europese Unie. Het uitbreiden van het aantal terreinen waar het Parlement mag meebeslissen en de Raad met gekwalificeerde meerderheid stemt, zou de EU volgens sommigen democratischer en besluitvaardiger maken.
